• Las arenas de kombate son 4 escenarios de MK1 + 9 de MKII + 17 de MK3/UMK3 (30 en total).

• Palace Gates, Throne Room y Warrior Shrine (todos de MK1) son los únicos 3 escenarios que no están incluídos en ésta entrega debido a que el 2do es un espacio personal del viejo Shang Tsung (no acorde a la historia) y el 3ero incluía las imágenes de los personajes en su versión original (del 1er juego), haciendo también presencia de los actores que ya no formaron parte del elenco de 1996. Se desconoce por qué el 1ero fué removido... En caso de The Pit I y II en N64 no fueron incluídos en su versión original, más bien fué presentada una modificación de cada uno de ellos. Ya en PSX, PC y Sega Saturn se presentó The Pit I como la unión de éstos 2 escenarios, sin embargo The Pit II continuó intacto.

• Se incluyeron composiciones de MKII y MK3/UMK3 con unas tonalidades más bajas debido a que el tiempo (pitch) fué atrasado, haciendo así las armonías más pesadas (lentas). En caso de los 4 escenarios de MK1, les acompañan composiciones de MK3/UMK3 *

* Armonías de MK1 Reemplazadas:
   ∟ The Courtyard con la composición musical asignada para The Rooftop
   ∟ The Pit I y Pit Bottom con la composición musical asignada para Scorpion's Lair
   ∟ Goro's Lair con la composición musical asignada para Soul Chamber

• Fueron removidas las Stage Fatalities de The Pit I y II al no tener capturados los movimientos de caída de cada personaje, ni tampoco se tuvo en cuenta el hecho de realizar el mo-cap siquiera por el simple hecho de ser un proyecto en que se reutilice material de los anteriores títulos y no que se agregue nada nuevo (a excepción de Cage).

• Se han modificado 4 arenas y alterado (fusionado) 1 escenario, entre ellos: The Pit I y II, The Courtyard (MK1) y The Portal (MKII).


* The Pit I (Modificado): Cambiado el cielo, reemplazando el fondo azul marino y nubes corredizas por una total oscuridad (cielo negro) con una luna llena reducida en tamaño y estrellas blancas. Exclusivo para N64 (en las otras versiones aparece una fusión entre The Pit I y II como se muestra en la anterior 3er imagen).

* The Pit II (Modificado): Al igual que en The Pit I, el cielo fué reemplazado por una tonalidad negra, sin luna pero aún con estrellas. Fueron eliminados del fondo Hornbuckle y Torch del 2do puente. Exclusivo para N64 (en las otras versiones figura como el original de MKII). Éste remake es conocido (registrado en el juego) como Star Bridge.

* The Pit (Alternativo de The Pit I): Fusión entre The Pit I y II, con el puente de 1 y el cielo del 2. En ninguno de los 3 anteriores casos se presentan las figuras traspasando la luna. Éste escenario es incluído en todas las versiones a excepción de N64. Por otra parte, en dichas versiones (PSX, PC y Sega Saturn) se incluye The Pit II de manera original.

* The Courtyard (MK1): Oscurecido el cielo con una tonalidad más índigo que celeste como se muestra en el original, reemplazando también de fondo a Shang Tsung por Shao Kahn en su trono. Escenario incluído en todas las versiones.

* The Portal (MKII): Agregado a los costados unos "puestos de vigilancia" como se aprecian en los templos chinos. Escenario incluído en todas las versiones.